代谢网络完成。根据修复网络的反应计算拔模网络的最小完工量。
meneco的Python项目详细描述
安装
您可以通过运行以下命令安装meneco：
> pip install --user meneco
在Linux上，可执行脚本可以在~/.local/bin
在macos上，脚本位于/Users/YOURUSERNAME/Library/Python/3.2/bin下。
使用命令行界面
典型用法是：
> meneco.py -d draftnetwork.sbml -s seeds.sbml -t targets.sbml -r repairnetwork.sbml
有关更多选项，您可以按以下方式寻求帮助：
> meneco.py --h
usage: meneco.py [-h] -d DRAFTNET -s SEEDS -t TARGETS [-r REPAIRNET]
[--enumerate]
optional arguments:
-h, --help show this help message and exit
-d DRAFTNET, --draftnet DRAFTNET
metabolic network in SBML format
-s SEEDS, --seeds SEEDS
seeds in SBML format
-t TARGETS, --targets TARGETS
targets in SBML format
-r REPAIRNET, --repairnet REPAIRNET
perform network completion using REPAIRNET a metabolic
network in SBML format
--enumerate enumerate all minimal completions
使用库
有关指导示例，请参见演示ipythonNotebook。
样本
外腕骨重建的示例文件如下：ectocyc.sbml，metacyc_16-5.sbml，seeds.sbml，targets.sbml
欢迎加入QQ群-->： 979659372
