k-bags卷积神经网络(kcon)支持的分子动力学(md)模拟。

kconmd的Python项目详细描述


kconmd(k袋卷积神经网络分子动力学)

python versionPyPIBuild StatusCoverage Statuscodecov

k-Bags Convolutional Neural Network (kCON)支持的分子动力学(md)模拟。

作者:曾金哲

电子邮件:jzzeng@stu.ecnu.edu.cn

Research Group

确认

非常感谢Xin ChenkCON的帮助和开发。

要求

安装

pip

pip install kconmd

从源构建

$ git clone https://github.com/njzjz/kconmd
$ cd kconmd/
$ pip install .

示例

简单示例

examples/example.py

客户机-服务器模式

examples/server.pyexamples/client.py

与lammps一起运行md

请参阅njzjz/Pyforce存储库并安装pyforce模块。然后将examples/client.py重命名为force.py,并将其放在运行lammp的地方。在lammps输入文件中添加一行:

fix 1 all pyforce C H O

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