用于探索和分析基因组数据的可扩展库。
j11hail的Python项目详细描述
冰雹
Hail是一个开源的、通用的、基于Python的数据分析工具,提供了处理基因组数据的额外数据类型和方法。在
Hail是按规模构建的,对多维结构化数据有一流的支持,比如全基因组关联研究(GWAS)中的基因组数据。在
冰雹作为Python库公开,使用原语进行分布式查询,并在Scala、^ {A3}和日益C++中实现线性代数。在
有关使用Hail的更多信息,请参见documentation。在
社区
Hail被广泛应用于学术界和工业界,包括作为genome aggregation database和{a6}的分析平台。了解有关Hail-powered science的详细信息。在
贡献
如果您想讨论或参与开发方法或基础设施,请:
- 有关编译Hail的信息,请参阅安装指南的For Software Developers部分
- 与我们聊聊我们的Zulip chatroom的发展
- 请访问Development Forum获取更长的表单讨论
Hail在软件开发中使用了连续部署方法,这意味着我们经常添加新特性。我们通过Discussion Forum向用户更新对Hail的更改。我们建议您在论坛上创建一个帐户,以便您也可以订阅这些更新。在
维护人员
Hail由Neale lab中的Stanley Center for Psychiatric Research和{a16}的Analytic and Translational Genetics Unit维护。在
请致电^{
Citing Hail
If you use Hail for published work, please cite the software. You can get a citation for the version of Hail you installed by executing:
^{pr 1}$Which will look like:
^{pr 2}$Acknowledgements
The Hail team has several sources of funding at the Broad Institute:
- The Stanley Center for Psychiatric Research, which together with Neale Lab has provided an incredibly supportive and stimulating home.
- Principal Investigators Benjamin Neale and Daniel MacArthur, whose scientific leadership has been essential for solving the right problems.
- Jeremy Wertheimer, whose strategic advice and generous philanthropy have been essential for growing the impact of Hail.
We are grateful for generous support from:
- The National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
- The National Institute of Mental Health
- The National Human Genome Research Institute
- The Chan Zuckerberg Initiative
We would like to thank Zulip联系海尔团队以获得支持 通过提供免费托管和YourKit,LLC慷慨提供 开放源码开发的YourKit Java Profiler免费许可证。在
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