区间装箱方案的python实现

interval-binning的Python项目详细描述


以下是一些用于处理区间装箱方案的实用函数 在UCSC Genome Browser中使用。此方案可用于 实现基于重叠的快速间隔查询,基本上模拟 R-tree索引。

注意,有些数据库系统本机支持空间索引方法,如 R-树。例如,请参见的PostGIS扩展 PostgreSQL。

虽然原则上这种方法可以用于任何类型的 间隔,请注意此实现支持的最大位置 是2^29(覆盖了人类最长的染色体)。

用法

请参阅documentation

安装

使用pip通过pypi安装最新版本:

pip install interval-binning

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
java如何忽略缓冲读取器中在“”之后的行的其余部分,或行上的特定字符?   java在db中创建空对象或稍后保存   java如何实现UI无关的后台工作任务   java未能在Android中从BaseAdapter扩展的类中启动Tactivity?   java斐波那契迭代移动数组[]   安卓从文件读取提供了java。木卫一。StreamCorruptedException:无效的流标头:73720027   java计算矩形中的六边形数?   仅使用Java 1.5(或更早版本)读写XML   java如果所有元素都以相同的bucked结尾,为什么要进行大小调整?   java Apache POI Excel在xx中发现无法读取的内容。xlsx   swing我可以在普通java应用程序中使用GWTGUI吗?   来自自定义Java客户端的http删除请求的行为与邮递员不同   运行批处理文件时,java当前目录无效   使用TypeReference将java字符串转换为ArrayList<STRING>   documentlistener突出显示所有匹配词Java