用于探索和分析基因组数据的可扩展库。
hail4j11的Python项目详细描述
冰雹
Hail是一个开源的、通用的、基于Python的数据分析工具,提供了处理基因组数据的额外数据类型和方法。
Hail是按规模构建的,对多维结构化数据有一流的支持,比如全基因组关联研究(GWAS)中的基因组数据。在
冰雹作为Python库公开,使用原语进行分布式查询,并在Scala、^ {A3}和日益C++中实现线性代数。在
有关使用Hail的更多信息,请参见documentation。在
社区
Hail被广泛应用于学术界和工业界,包括作为genome aggregation database和{a6}的分析平台。了解有关Hail-powered science的详细信息。在
贡献
如果您想讨论或参与开发方法或基础设施,请:
- 有关编译Hail的信息,请参阅安装指南的For Software Developers部分
- 与我们聊聊我们的Zulip chatroom的发展
- 请访问Development Forum获取更长的表单讨论
Hail在软件开发中使用了连续部署方法,这意味着我们经常添加新特性。我们通过Discussion Forum向用户更新对Hail的更改。我们建议您在论坛上创建一个帐户,以便您也可以订阅这些更新。在
维护人员
Hail由Neale lab中的Stanley Center for Psychiatric Research和{a16}的Analytic and Translational Genetics Unit维护。在
请致电hail@broadinstitute.org联系海尔团队。在
引用Hail
如果你使用海尔出版的作品,请引用该软件。你可以得到 通过执行以下操作安装的Hail版本的引文:
importhailashlprint(hl.citation())
看起来像:
^{pr2}$致谢
海尔团队在博德研究所有几个资金来源:
- 斯坦利精神病研究中心,与尼尔实验室一起提供了一个令人难以置信的支持和刺激的家。在
- 首席研究员本杰明·尼尔和丹尼尔·麦克阿瑟,他们的科学领导能力对于解决正确的问题至关重要。在
- 他的战略建议和慷慨的慈善事业对海尔的影响不断扩大至关重要。在
我们感谢以下各方的慷慨支持:
- 国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所
- 国家精神卫生研究所
- 国家人类基因组研究所
- 陈扎克伯格倡议
我们要感谢祖利普的支持 通过提供免费托管和YourKit,LLC慷慨提供 YourKit Java的免费许可证 用于开源开发的探查器。在
- 项目
标签: