一个易于使用的停靠库。
dockerasmus的Python项目详细描述
通过大学对接
dockerasmus是一个与版本无关的python模块，它是创建的
作为python赋值的一部分，快速解决对接问题
巴黎萨克利大学的m1围嘴。 dockerasmus提供评分函数的通用实现，
它可以与几个components一起使用来计算
包含两种蛋白质的对接构象。它是后端不可知论的，而且
每个评分组件都可以用任何支持的库重写
numpy数组。 使用dockerasmus计算barnase-barstar复合体的得分
使用由Cornell et al： dockerasmus提供几个子模块： 见API reference
从联机文档获取更多详细信息。 dockerasmus是完全开源的，在gplv3下发布。 欢迎加入QQ群-->： 979659372
简介
示例
fromdockerasmus.pdbimportProteinfromdockerasmus.scoreimportScoringFunction,components# Import the pdb files (supports gzipped files or plain .pdb)barnase=Protein.from_pdb_file("tests/data/barnase.native.pdb.gz")barstar=Protein.from_pdb_file("tests/data/barstar.native.pdb.gz")# Create a scoring function with two componentsscoring_function=ScoringFunction(components.LennardJones,components.Coulomb)# Call the scoring function on the barnase (receptor)# and the barstar (ligand)scoring_function(barnase,barstar)# -84.94...
API
许可证
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