偶极EPR谱数据分析综合包
DeerLab的Python项目详细描述
在
关于
DeerLab是一个Python包,用于分析偶极EPR(电子顺磁共振)光谱数据。偶极EPR光谱技术包括DEER(双电子电子共振)、RIDME(弛豫诱导偶极调制增强)等。文档可以在here找到。在
DeerLab由一系列用于建模、数据处理和最小二乘拟合的函数组成。它们可以在脚本中组合以构建自定义数据分析工作流。DeerLab支持两类距离分布模型:非参数(Tikhonov正则化和相关)和参数(多高斯等)。它还提供了背景和实验模型的选择。在
DeerLab的早期版本(直到0.9版本)是用MATLAB编写的。旧的MATLAB代码库已存档,可以找到here。在
要求
DeerLab可用于Windows、Mac和Linux系统,需要Python 3.6、3.7或3.8。在
在安装过程中,会自动下载并安装所有其他依赖项。在
设置
可以使用pip
安装预构建发行版。在
首先,确保pip
是最新的。从终端(最好具有管理权限)使用以下命令:
python -m pip install --upgrade pip
接下来,使用
^{pr2}$有关DeerLab安装的更多详细信息可以在here找到。在
引文
当您在工作中使用DeerLab时,请引用以下出版物:
DeerLab:分析偶极电子顺磁共振谱数据的综合软件包
路易斯•F•布雷加斯•伊布•埃兹、冈纳•杰施克、斯特凡•斯托尔马格恩。Reson.,1209–2242020年2242020年
doi.org/10.5194/mr-1-209-2020
许可证
DeerLab工具箱是在MIT License下授权的。在
版权所有(c)2019-2020:Luis FÓbregas IbÔez、Stefan Stoll、Gunnar Jeschke和other contributors。在
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