在杆状单元中创建坐标系。
colicoords的Python项目详细描述
项目目标
colicoords是一个python项目,用于分析rodlike细胞的荧光显微镜数据。该项目的目标是成为一个开放的、文档齐全的平台,用户可以通过紧凑的hdf5文件和以jupyter笔记本形式的分析管道轻松共享数据。
安装
ColiCoords在pypi和conda forge上可用。目前,python>;=3.6是必需的。
由Conda安装。
conda install -c conda-forge colicoords<>安装PyPi时,需要安装一个C++编译器来安装依赖项mahotas。或者,mahotas可以与conda分开安装。
从pypi安装ColiCoords:
pip install colicoords
尽管colicoords具有自动测试的功能,但很可能存在bug。我们鼓励用户通过github上的问题页面进行报告。
联系人:jhsmit@gmail.com
示例
可以在examples目录中找到几个使用colicoords的例子。