将mirbase转换为bel
bio2bel-mirbase的Python项目详细描述
枚举mirbase命名空间,生成等价表,并预测mti关系
安装
bio2bel_mirbase可以使用GitHub上的最新代码安装:
$ python3 -m pip install git+https://github.com/bio2bel/mirbase.git@master
参考文献
- http://www.mirbase.org/
- http://identifiers.org/mirbase/和http://identifiers.org/mirbase.mature/
- 安娜·科佐马拉,萨姆·格里菲斯·琼斯;miRBase: annotating high confidence microRNAs using deep sequencing data。核酸研究2014;42(D1):D68-D73。