bhmm:单分子轨道的贝叶斯隐马尔可夫模型分析工具包。

bhmm的Python项目详细描述


这个项目提供了估算亚稳态数、速率的工具。 状态之间的常数,平衡布居,分布 描述状态的特征,以及这些量的分布 单分子数据。这些数据可能是FRET数据,单分子拉力 数据,或一个或多个可观测数据记录为 时间。隐马尔可夫模型(HMM)被用来解释观察到的动力学, 然后用贝叶斯方法对符合数据的模型分布进行抽样 推理技术和马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC),允许 模型中不确定性的表征及期望值的建模 通过新的实验获得信息。

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