autogenes 1.0.4

自生子

自体基因自动提取信息基因，揭示大样本RNA的细胞异质性。自体基因不需要标记基因的先验知识，通过同时优化多个标准来选择基因：最小化相关性和最大化细胞类型之间的距离。它可以应用于各种来源的参考资料，如单细胞实验或分类细胞群体。在

对于多目标优化问题，通常不存在同时优化所有目标的单一解。在{/str}的情况下，{str}可能存在无限多个目标函数。Pareto-（半）最优解是所有解的集合，这些解不受任何其他探索解的支配。帕累托最优解提供了一组同样好的解决方案，可以根据数据集进行选择

安装

1. 在

   仅PyPI
   pip install autogenes
   

   在
2. 在

   开发版本（github上的最新版本）
   git clone https://github.com/theislab/AutoGeneS
pip install dist/autogenes-1.0.3-py3-none-any.whl
   

   在

示例

Example on pseudo bulks

文件

Documentation

Getting Started

依赖关系

• python>；=3.6
• 熊猫>；=0.25.1
• anndata>；=0.6.22.post1
• 数量=1.17.2
• dill>；=0.3.1.1
• deap>；=1.3.0
• scipy>；=1.3
• cachetools>；=3.1.1
• scikit learn>；=0.21.3
• matplotlib>；=3.0

引文

Aliee, Hananeh and Theis, Fabian, AutoGeneS: Automatic gene selection using multi-objective optimization for RNA-seq deconvolution

标签：

• 项目

欢迎加入QQ群-->： 979659372

推荐PyPI第三方库

• audiowire

  从手机收听PC声音

• river

  没有项目描述

• reqtxtupd8

  将包列表写入requirements.txt

• dnspace

  文档需要空间

• redismutex

  用redis实现互斥锁的python实现

• cantor

  见https://github.com/gioenn/cantor

• configpp

  一个配置管理器库为更光明的未来！

• bvh-converter

  将bvh文件转换为csv

• autods

  没有项目描述

• azure-functions-worker

  azure函数宿主的python语言工作程序

• berrymq

  没有项目描述

• toolsnetwork

  一个非常简单的网络库，用于分离由rohit g bal（@rohitbbal）编写的mac帧。

• darkbox

  便携式一体化跨平台工具包。

• microcosm-eventsource

  使用微观世界的事件源状态机

• pydef

  python分析工具