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atooms-models的Python项目详细描述
ATOMS模型
经典分子动力学和蒙特卡罗模拟模型数据库
快速入门
显示数据库中的所有模型
fromatooms.modelsimportdatabasedatabase.show()
打印完整的数据库
^{pr2}$选择Lennard-Jones单组分系统并检查参数
model=database["lennard_jones"]print(model["potential"])print(model["cutoff"])
现在寻找一个流体伦纳德琼斯样品，并得到一个本地副本
fromatooms.modelsimportcopyforsampleinmodel["samples"]:ifsample["state"]=='fluid':local_file=copy(sample)break
然后可以使用local_file开始使用atooms包进行模拟或进一步分析。在
安装
克隆代码库并从源代码安装
git clone https://gitlab.info-ufr.univ-montp2.fr/daniele.coslovich/atooms-models.git
cd sample
make install
（尚不可用）使用pip安装Atoms模型
pip install atooms-models
作者
丹尼尔科斯洛维奇：http://www.coulomb.univ-montp2.fr/perso/daniele.coslovich/
- 项目
标签：
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