自动化系统基因组学管道。
agalma的Python项目详细描述
- agalma是一个自动工具，它为
- 系统基因组分析，允许复杂的系统基因组分析 作为一系列高级 命令。用户提供原始Illumina转录体数据，以及 agalma生成带注释的程序集，对齐的基因序列矩阵， 初步的系统发育和详细的诊断 研究者对中间分析进行广泛评估 步骤和最终结果。其他来源的序列，如 外部组装的基因组和转录体，也可以 包含在分析中。Agalma是在生物岩上建造的 生物信息学框架，跟踪来源，轮廓处理器 以及内存使用、记录诊断、管理元数据、安装 依赖项、记录版本号和对外部程序的调用，以及 为分析的所有阶段启用丰富的HTML报表。阿伽玛 包括一个小的测试数据集和一个内置的测试分析 数据。
欢迎加入QQ群-->： 979659372
