用Python解析.pdb文件我正在尝试为.pdb文件编写一个快速解析器(它们显示蛋白质结构)。我正在研究的一种蛋白质的例子是KRAS(常见于癌症),这里是:http://www.rcsb.org/pdb/files/3GFT.p ...2024-05-17 已阅读: n次
在Python3中查找字符串模式并为多次出现打印以下字符10年后我刚刚重新开始编程,现在我正在努力学习Python。我正在攻读生物化学学位,想用编程来分析DNA序列。我需要在一个序列中找到所有的“ga”、“gc”、“gg”和“gt”模式,并将下游的3个碱基 ...2024-05-17 已阅读: n次
Python/pandas中组合数据帧的自动生成我对熊猫和Python还很陌生,我有生物化学和药物发现的背景。我想自动化的一个常见任务是将药物治疗和蛋白质的组合列表转换为包含所有这些组合的格式。在 例如,如果我有一个包含给定组合集的数据帧: htt ...2024-05-17 已阅读: n次
gillespy2 gillespy2是一个用于生化系统随机模拟的python包。它提供了一种面向对象的方法来创建生物系统的数学模型,以及对这些模型进行时间模拟的各种方法。这些方法包括:gillespie直接法(s ...2024-05-17 已阅读: n次
pyIMD 欢迎来到皮姆德! 质量随时间的演化和相应的显微镜图像显示了20分钟的时间跨度。 质量数据每10毫秒采集一次(数据显示为黑色),覆盖红色为滚动平均值,窗口为 1000英镑。在观察 ...2024-05-17 已阅读: n次