Python中的细胞分割与荧光计数 我如何从显微镜上拍摄的图像中,沿着在Matlab中所做的行来分割细胞? http://blogs.mathworks.com/steve/2006/06/02/cell-segmentation/ ...2024-07-08 已阅读: n次
颜色/标记按索引seaborn scatterp是否可以构造一个散点图,其中包含索引的特定标记和颜色(在这里作为索引提供,或者可以是用于转置的列),其中列提供了不同的类。i、 组内染色,保持组间一致。在 import pandas as pd df ...2024-07-08 已阅读: n次
我需要了解如何将dataframe列中的值更改为另一datafram中的值我有两个数据表。表1称为术语,包含三列:P_术语、STRESC和CATEGORY。看起来是这样的: P_术语应力分类 __________ _______ ________ 变色的头发 变色的皮 ...2024-07-08 已阅读: n次
分叉、守护和监视python脚本我有一个python脚本sc.py公司在我的debian服务器上。在 我想: 以守护进程的身份运行它并使其无限期运行 在// 监控整个过程(以便重新启动任何染色过程) 你知道能让我这么做的软件吗? ...2024-07-08 已阅读: n次
如果有多个交叉点,有没有办法在嵌套列表中交换元素我有一个嵌套列表,如下所示: d4 = [[[a11, b11], [a12, b12]], [a21, b21], [a22, b22]]] 这意味着代表2条同源染色体的4个姐妹染色 ...2024-07-08 已阅读: n次
关于深度学习实施的问题我对编码有点陌生,但目前正试图将应用机器学习用于生物学研究项目。我正在尝试创建一个神经网络,它将获取绿色通道蛋白质图像的输入,并猜测同一图像的红色通道 我有一个10000个40x40图像的数据集,其中 ...2024-07-08 已阅读: n次
RGB到HSD转换我正在跟踪一个paper中,他们将医学幻灯片从RGB转换为HSD(色调饱和度密度)。色调和饱和度通道与HSV中的相同,但使用通道密度D_ch计算密度: 其中,分子表示通道ch(R、G或B)的强度,分 ...2024-07-08 已阅读: n次
将单元分割结果转换为强度值表我正在尝试分割一个多路复用的细胞成像数据集。通常会得到一个二维的预测细胞/细胞核标签数组作为结果。用于说明输入和输出的图: 下一步是量化每个细胞的每个抗体/染色强度。不知何故,我没有看到任何教程中讨 ...2024-07-08 已阅读: n次
在显微镜研究中绘制非均匀组织的边界我正在编写一个OpenCV脚本来分析免疫组织化学染色的心脏组织。我们的染色程序在光学显微镜下用可见的色素使细胞膜中表达某些蛋白质的细胞能够被我们用来拍摄图像。在 到目前为止,我已经使用OpenCV社区 ...2024-07-08 已阅读: n次
不同尺寸图像中的各种特征矩阵我有一个包含数百张代表H&;E骨髓染色。简单地说,细胞形态和骨髓结构因患者而异,为了量化这一点,我的目标是使用VGG16模型提取视觉特征 为了测试图像大小对特征矩阵的影响程度,我从完全相同的图 ...2024-07-08 已阅读: n次
有没有理由不总是使用漏泄的在我看来,Relu激活通常非常有效。而漏水的relu解决了它的主要缺点(染色单元) 所以除了需要tanh、soft max或sigmoid的输出层之外。有没有什么理由我不想使用leaky relu?( ...2024-07-08 已阅读: n次
色调分离:使用来自Image-J和scikit-imag的自定义染料矩阵我想使用scikit-image "stain_separation"方法和一个自定义的染色矩阵。 我使用了Image-J中的颜色反褶积插件来创建一个自定义矩阵。 当我使用这些值时,色斑分离根本不起作 ...2024-07-08 已阅读: n次
collective.chromatable 简介 要使用它,请按照以下步骤操作, Add collective.chromatable to your buildout eggs Run buildout Start zope Insta ...2024-07-08 已阅读: n次
stain染色 着色可以帮助你在终端输出中着色而不必担心格式化类, 替换打印函数,或使用熟悉的字符串操作以外的任何操作。 开始 使用基本的污渍是快速和容易的。 Stain提供了一个上下文管理器,用于处理格式的预 ...2024-07-08 已阅读: n次
flask-sqlalchemy-unchained烧瓶sqlalchemy unchen 集成SQLAlchemy Unchained和Flask。这个包是围绕Flask-SQLAlchemy的一个非常薄的包装,就在flask中注册扩展而言,一切都是 ...2024-07-08 已阅读: n次