Python 位点_专题 - Python中文网

当前热门话题： Python 位点: 本站为您提供最新、最全的位点的Python教程、文档、代码、资源等相关内容，Python中文网技术交流社区同时还提供学习资源下载，如：电子书、IDE编辑器软件、编程视频、代码规范标准、WEB开发、GUI、科学计算与人工智能等相关内容。

本文网址：https://cnpython.com/tags/254673
欢迎加入QQ群-->： 979659372

关于位点相关联的Python项目和问题：

如何加快在两个列表中查找匹配值的速度？

我试图从一系列可能的位置中找到基因组中重要的位置我首先确定可能的基因组位点并将其存储在一个列表中，然后创建另一个包含重要位点的列表，并循环检查每个重要位点是否在可能位点列表中生成重要位置和可能位置 ...

2024-05-03 已阅读: n次

设计这个类的最佳方法

上下文：大家好，请看这个问题。我是一名初级python程序员（两周内表现出色！）我相信我最初设计的课程很糟糕，我正在寻求帮助，寻找一个好的方法来重新设计基础课程（在Locus.py中）背景：到目前 ...

2024-05-03 已阅读: n次

Python数据帧将具有相同信息的行保留在3列中

如果您的python数据帧如下所示： ID_1 ID_2 haplotypeID locus A1 A1 hap.1.1 KIRa A1 A1 hap. ...

2024-05-03 已阅读: n次

Python将字符串中的多个位置切换为多个字母

我试图编写一个python代码，在DNA序列中找到限制性内切酶位点。限制性内切酶在特定的DNA序列上切割，但有些并不严格，例如XmnI切割该序列：砷化镓其中N可以是任何核苷酸（A、C、G或T）。如 ...

2024-05-03 已阅读: n次

找2D数组中的邻居数量使用convolve2d

我有一个二维格子（L*L），有固定的边界，并将N-S-W-E位点视为每个位点的4个邻居。每个站点都分配了一个浮点值。我是在计算其各自场地的平均增值。我想用化学信号. 以下是我的代码： # xi_out ...

2024-05-03 已阅读: n次

高效地将位置列表转换为二进制序列，以获得非常大的列表

我有一个非常大的位置列表（DNA位点），需要将其转换为一个二进制序列例如：输入： [3,5] # positions 3 and 5 输出： [0,0,1,0,1] # 1s only fo ...

2024-05-03 已阅读: n次

用scipy高斯和拟合曲线

我在做生物信息学，我们在mRNA上绘制小RNA。我们有一个蛋白质在每一个mRNA上的映射坐标，我们计算出蛋白质与mRNA结合的位置与小RNA结合位点之间的相对距离。在我获得以下数据集： dist ...

2024-05-03 已阅读: n次

有没有办法为字典列表中的下一个字典中的同一个键获取下一个值？

我有两个不同的词典列表，list_a和list_b。第一个字典列表包含核苷酸位点，另一个字典列表包含所有基因的起始和结束坐标。如果该位点在基因坐标范围内，则该位点属于该基因。然而，有时即使一个位点在这 ...

2024-05-03 已阅读: n次

用python计算字典中的基因突变

我有以下格式的数据： >；abc12 ATCGACAG >；def34 ACCGACG公司等等我把每一个基因都存储在一个字典里，以gt；开头的行作为值。所以字典是类似于{'abc12' ...

2024-05-03 已阅读: n次

与Pyspark一起使用第三方库

我一直在使用python的PYOD库，并一直在使用LOF、locis和CBLOF算法。现在我想使用Pyspark。我在pyspark MLlib上做了一些RnD。然而，我还没有在Pyspark中发现L ...

2024-05-03 已阅读: n次

大Pandas群体多指标allpairs比较

问题（正式）我有一个包含列a，b，c，d，a和b是一对多的，如（b和c）和（c和d）的一对多。d是唯一索引，e是任意整数。在让分组=数据框groupby（by=['a'，'b'，'c']）。然后， ...

2024-05-03 已阅读: n次

nanome-ligand-focus

纳米-配体焦点配体焦点允许用户在一次点击中突出显示配体及其结合位点。安装 $ pip install nanome-ligand-focus 使用量启动插件： $ nanome-ligand- ...

2024-05-03 已阅读: n次

protmapper

protmapper是一种工具，用于将ptm数据库和科学文献中发现的不一致蛋白质位点（即，与人类参考序列不匹配）映射到人类参考序列上的相应位置。 ...

2024-05-03 已阅读: n次

sprint

#冲刺 #张峰（15110700005@fudan.edu.cn） #pip install sprint #详情见http://sprint.tianlab.cn/SPRINT/ ...

2024-05-03 已阅读: n次

bio-pyvol

Pyvol pyvol是一个python库，用于识别蛋白质结合袋，将其划分为子袋，并计算其体积。虽然pyvol可以用来识别新的绑定口袋，但有许多算法已经针对该任务进行了优化。PYVOL用于描述已知的装 ...

2024-05-03 已阅读: n次

multi-locus-analysis

分析多个位点（扩散）的实用程序集合。围绕pandas数据框架设计的简单接口允许计算对每个实验或跨实验都很容易执行。许多关于聚合物扩散的分析结果包括比较。用法此软件包可以通过PIP安装 ...

2024-05-03 已阅读: n次

oldowan.mitomotifs

mitotimotis是一个小型、纯python的生物信息实用程序，用于（1）将人类有丝分裂软骨DNA序列数据转换为与修正剑桥参考序列（rcrs）和（2）变换变异位点数据转换成DNA序列。关于R ...

2024-05-03 已阅读: n次

oldowan.mtconvert

mtconvert是一个小型、纯python的生物信息实用程序，用于（1）将人类有丝分裂软骨dna序列数据转换为相对于修订的剑桥参考序列（rcrs）的变异位点，以及（2）将变异位点数据转换为dna序列 ...

2024-05-03 已阅读: n次

iCount

icount：蛋白质与rna相互作用分析 icount是一个python模块和相关的命令行界面（cli）。它提供处理ICLIP数据所需的所有命令蛋白质与rna的相互作用和产生：解复用和适 ...

2024-05-03 已阅读: n次

migverif

简介根据我们的经验，migrate-n在单形位点上不起作用。 migverify将遍历您的infile，并输出 infile_clean。默认情况下，migverify将删除所有少于两个的轨迹 ...

2024-05-03 已阅读: n次

extract-specific-sites-from-msa

从MSA中提取特定的站点 1简介 extract_specific_sites_from_msa是从多序列比对中提取某些位点（或密码子）的工具。 2安装 pip install extract_spe ...

2024-05-03 已阅读: n次

nanome-docking

纳米-对接将配体与受体对接并以纳米形式显示结果的插件安装 $ pip install nanome-docking 使用量启动插件： $ nanome-docking smina -a plu ...

2024-05-03 已阅读: n次

BioMine

生物信息学数据挖掘。目前，biomine与临床和基因组类型的位点相互作用，但其核心并不局限于任何单一的位点或领域。与临床医生、Ensembl、Entrez、Exac合作，并依赖于几个变体类的使用。 ...

2024-05-03 已阅读: n次

muesr

muesr是一个python包，它执行用实空间算法计算偶极场和偶极张量和 μ子自旋旋转和弛豫光谱。 ...

2024-05-03 已阅读: n次

flippyr

一个简单的python脚本来搜索等位基因开关，链翻转，多等位基因位点，模糊位点，还有Indels。输出为类似于.bim的形式表和日志文件。 ...

2024-05-03 已阅读: n次

CladeCompare

安装正确的安装方式如下： python setup.py install 如果您安装了setuptools，则依赖于生物井的依赖项 biopytho ...

2024-05-03 已阅读: n次

pyPRISM

<；img src='./tutorial/img/toc.png'width='500px'/>；<；p>；<；h1 align="center">；pypris ...

2024-05-03 已阅读: n次

integron_finder

Integron Finder的目的是通过发现整合子的特殊特征来检测DNA序列中的整合子：-attC位点-整合酶-以及可能的attI位点和启动子以及细菌基因组中的盒式阵列。jean cury；thom ...

2024-05-03 已阅读: n次

zymp

zymp是一个python库，用于设计“限制站点数组”，它是具有许多限制位点的紧凑序列。例如，这里有一个159个核苷酸序列，由zymp和49个酶组成识别站点（提供了52个）频率大约是每个位点3 ...

2024-05-03 已阅读: n次

phosphoprotools

收集处理磷酸蛋白质组学数据的功能，包括使用phosrs截止值注释磷酸位点、注释功能位点、检索同义词、公布计数、统计分析（通过pi评分法）等。 ...

2024-05-03 已阅读: n次

TFBS-footprinting

tfbs_示意图 "transcription factors"通过kelvin13派生而来，用于cc by 3.0 完整文档可在以下位置获得：阅读文档 1背景基于jaspar数据库中的结合数据 ...

2024-05-03 已阅读: n次

Python 位点

关于位点 相关联的Python项目和问题：

关于位点相关联的Python项目和问题：