删除字符串中的字符

Question

我有一个fasta文件，它的头不包括序列名和长度

>1 9081 bp 
gcgcccgaacagggacttgaaagcgaaagagaaaccagagaagctctctcgacgcagga

我需要删除名称“1”之后的所有内容，并尝试在python中通过以下方式执行此操作：

newfile.write(oldfile.replace("bp",""))

这删除了“bp”，但我现在仍然有数字。你知道吗

>1 9081
gcgcccgaacagggacttgaaagcgaaagagaaaccagagaagctctctcgacgcagga

我如何指定这个术语：任何字符后跟bp将被替换为nothing。我试过***血压或---血压或…血压，但都不起作用。你知道吗

谢谢！ 拉德瓦

Answer 1

为此，应该使用正则表达式。你知道吗

尝试此操作（假设文件名可能包含1个以上的字符，并且可能包含数字和字母）：

import re

regex = re.compile(r'(^\w+)\s.*', re.DOTALL)
print(regex.sub(r'\1', '1 9081 bp\ngcgcccgaacagggacttgaaagcgaaagagaaaccagagaagctctctcgacgcagga' ))
print(regex.sub(r'\1', 's12d 9081 bp\ngcgcccgaacagggacttgaaagcgaaagagaaaccagagaagctctctcgacgcagga' ))

输出：

1 
s12d