我已经安装了biopython
和相关的模块,但是当我尝试将它们作为
from BCBio.GFF import GFFExaminer
import pprint
from BCBio import GFF
它抛出以下错误
---------------------------------------------------------------------------
ModuleNotFoundError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-44-5e2a9411b6ce> in <module>
----> 1 from BCBio.GFF import GFFExaminer
2 import pprint
3 from BCBio import GFF
4 import gzip
5 import numpy as np
~/software/anaconda/lib/python3.7/site-packages/BCBio/GFF/__init__.py in <module>
1 """Top level of GFF parsing providing shortcuts for useful classes.
2 """
----> 3 from BCBio.GFF.GFFParser import GFFParser, DiscoGFFParser, GFFExaminer, parse, parse_simple
4 from BCBio.GFF.GFFOutput import GFF3Writer, write
5
~/software/anaconda/lib/python3.7/site-packages/BCBio/GFF/GFFParser.py in <module>
30 collections.defaultdict = _utils.defaultdict
31
---> 32 from Bio.Seq import UnknownSeq
33 from Bio.SeqRecord import SeqRecord
34 from Bio import SeqFeature
ModuleNotFoundError: No module named 'Bio'
Python版本:Python 3.7.2 pip版本:pip 18.1
当我这么做的时候 pip列表
我在列表中看到了bio
和biopython
bio 0.1.0
biopython 1.74
bcbio-gff 0.6.6
bcrypt 3.1.6
binaryornot 0.4.4
bio 0.1.0
biopython 1.74
bleach 3.0.2
boto3 1.9.139
botocore 1.12.139
如有任何建议或帮助,我们将不胜感激。你知道吗
您的pip list
未显示已安装的bcbio-gff包。尝试:
你知道吗 进一步说明,bio是一个分析包,可能不是您想要的。你知道吗
尝试创建新的virtualenv:
然后再次尝试运行脚本。你知道吗
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