我正在尝试从一个数据帧构建networkx图,在绘制时使用节点的位置数组。我遇到的问题是将列包含为边属性时。如果属性列是类型float,它将把节点id(int)的值转换为float类型,这将导致networkx的draw函数的位置数组中的索引问题。你知道吗
可以通过在 节点和边都被创建了,但是我觉得应该有一种方法来实现这一点,所以我遗漏了一些明显的东西。你知道吗
谢谢你的帮助。你知道吗
import networkx as nx
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
#set up datae frame
UpNodes =np.array([0,0,1,1,2,2,6,6,8,8,10], dtype=np.int)
DownNodes=np.array([1,2,3,4,4,5,7,8,9,10,11], dtype=np.int)
ORDER =np.array([2,1,1,1,3,2,1,1,1,2,3],dtype=np.float) #toggle this from int to float
df=pd.DataFrame(
{'UpNodes': UpNodes,
'DownNodes':DownNodes,
'ORDER': ORDER},
columns=['UpNodes','DownNodes','ORDER'])
#create array of spatial positions for nodes
pos=np.array(
[[ 0., 0. ],
[ 1., 0.5 ],
[ 1., -0.5 ],
[ 2., 1. ],
[ 2., 0.25],
[ 2., -1. ],
[ 3., 2. ],
[ 4., 3. ],
[ 4., 1. ],
[ 5., 2. ],
[ 5., 0. ],
[ 6., 0. ]]
)
plt.figure('Im a plot')
print df
print df.dtypes
G=nx.from_pandas_edgelist(df,'UpNodes','DownNodes','ORDER')
print G.edges
nx.draw(G, pos, node_size=90, with_labels=False)
print 'Done'
plt.show()
好的,是的,阅读文档真的很有帮助,因为这个问题就在那里。对于其他任何想绕过这个问题的人,你可以自己编写一个使用itertuples而不是iterrows的程序,这样就不会保留数据类型。你知道吗
其中attributes是列标题的列表(在我的例子中只是['ORDER'])
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