用多个字符替换字符串中的两个字符？

Question

所以我在解决这个问题时遇到了麻烦。 假设我让一个用户输入一个我们想在字符串中找到的序列。但是他们可以输入“X”，在那里它将被替换为4个字符并搜索字符串。例如，如果用户输入AXXT，它将在字符串中搜索AGCT、AGGT等。因此我尝试这样做：

y_re = y.replace('X', '[ACGT]')

然而，这并不重叠，所以我进入AXX，它只给我AAC。有人知道我怎么解决这个问题吗？你知道吗

Answer 1

像其他评论者所说的，请提供一个最小的，完整的，可验证的例子与样本数据和预期的产出。你知道吗

但我想我明白你想做什么。假设，您有序列ACATGT，用户输入AXXT，然后您希望找到重叠的子序列ACAT和ATGT。使用正则表达式的方法是使用positive lookahead：(?=...)。你知道吗

import re
sequence = 'ACATGT'
user_input = 'AXXT'

pattern = user_input.replace('X', '[ACGT]')
pattern = '(?=({}))'.format(pattern )

m = re.findall(pattern, sequence)
print(m)