将itk（nifti文件）转换为polydata图像（.vtk）

Question

我正在使用nifti格式（.nii）的MRI数据库，但我想将它们转换为polydata图像.vtk。 我使用了许多不同的方法：像miconv、itksnap，我下载vtk、itk和itkvtkglue。。。 但是没有人给我一个好结果。 所以请帮帮我。你知道吗

Answer 1

这是ITK-SNAPenter image description here的输出

Answer 2

这是miconventer image description here的输出

Answer 3

如果我正确地理解了nii文件是体积数据，因此除非从中创建isosurface，否则不能将其“转换”为多边形数据，请尝试：

from vtkplotter import load
vol = load('myfile.nii') #vtkVolume
vol.isosurface().show()
# or convert to vtk format:
vol.write('newfile.vti')