Dendropy interop模块python

Question

我目前正在尝试使用python Dendropy库，并在代码中包含一些PAUP命令。在

我使用的是python library中提到的教程，但它给了我一个错误。在

所以我要做的是从距离矩阵来估计一棵树：

距离矩阵A（Numpy数组）

[[ 0  2  7  8 16 17]
 [ 2  0  5  6 17 16]
 [ 7  5  0  9 15 13]
 [ 8  6  9  0 18 16]
 [16 17 15 18  0  5]
 [17 16 13 16  5  0]]

import dendropy
from dendropy.interpop import paup     

#A is a distance matrix like this    

tree = paup.estimate_tree(A, 'nj')

我得到的错误是：ImportError: No module named interpop

我已经在我的机器上安装了PAUP，教程没有讨论安装任何附加模块。在

任何帮助都将不胜感激。在

编辑 这对NUMPY数组有效吗？？因为它似乎给出了numpy数组的错误。。如何解决这个问题？？在

Answer 1

尝试使用from dendropy.interop import paup（减去interpop中的p）。我在写这个答案的时候打错了两次，所以如果这是错误的原因，那么这是可以理解的：）