基于其他datafram中的列映射数据帧

Question

我有两个DataFrames。一个看起来像这样：

df1.head()
#CHR    Start   End Name
chr1    141474  173862  SAP
chr1    745489  753092  ARB
chr1    762988  794826  SAS
chr1    1634175 1669127 ETH
chr1    2281853 2284259 BRB

第二个DataFrame如下所示：

^{2}$

我希望从两个DataFrames映射前三列，并创建一个新的DataFrame，df3。例如，如果df1和df2中的#chr相等，则查找df2.start >= df1.start和{}。在

如果是这种情况，请按以下方式打印：

df3.head()

#chr    start   end Name
chr1    141477  173860  SAP
chr1    745500  753000  ARB

到目前为止，我尝试创建一个函数来执行此操作：

def start_smaller_than_end(df1,df2):
    if df1.CHR == df2.CHR:
        df2.start >= df1.Start
        df2.End <= df2.End

    return df3

但是，当我运行它时，我得到以下错误：

df3(df1, df2)
name 'df3' is not defined

如有任何建议和帮助，我们将不胜感激。在

Answer 1

我想你可以用^{}和^{}：

df = pd.merge(df1, df2, how='outer', left_on='#CHR', right_on='#chr')

df = df[(df.start >= df.Start) & (df.end <= df.End)]
df = df[['#chr','start','end','Name']]
print (df)
   #chr   start     end Name
0  chr1  141477  173860  SAP
3  chr1  745500  753000  ARB

按注释编辑：

函数start_smaller_than_end：

^{pr2}$