通过rpy2将ggplot2图形保存到Python bu中

Question

我试图将使用rpy2创建的ggplot2R对象的输出保存到Python控制的缓冲区中。在

我可以使用matplotlib来实现这一点，但我似乎无法通过rpy2使用ggplot2来实现。在

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在matplotlib.pyplot中，这可以通过以下方式实现：

import matplotlib.pyplot as plt
import io
import numpy

def test_save():
    x = numpy.linspace(-5, 5)
    y = 3*x + 2
    fig = plt.figure()
    plt.plot(x, f)
    buf = io.BytesIO()
    plt.savefig(buf, format = 'png')
    return buf

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ggplot2尝试：

^{pr2}$

错误：

NotImplementedError: Conversion 'py2ri' not defined for objects of type ''

我试图使用^{}功能。在

Answer 1

R的ggplot2::ggsave需要一个字符串，指定路径（相对或绝对）作为参数filename的参数。例如"/this/is/my/figure.png"。在

Python BytesIO对象是完全不同的。它是一个内存中的二进制流（大致是Python对象，其行为类似于（二进制）文件）。在

如果使用ggsave不是绝对要求，请考虑使用 rpy2.robjects.lib.grdevices.render_to_bytesio()。这是一个在Jupyter笔记本中显示内联数字的函数：

from rpy2.ipython.ggplot import image_png
# pp is your ggplot2 figure
display(image_png(pp))