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用python计算字典中的基因突变
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<p>我有以下格式的数据:</p> <p>>;abc12 <br/>ATCGACAG<br/><br/> >;def34<br/> ACCGACG公司</p> <p>等等</p> <p>我把每一个基因都存储在一个字典里,以gt;开头的行作为值。所以字典是类似于{'abc12':'atcgag'等的东西</p> <p>现在我希望能够比较每个基因,这样它就可以计算出每个位点的A、T、C或G的数量。在</p> <p>我唯一能想到的就是把字典分解成每个核苷酸站点的列表,并使用zip()和一个计数器。这是最好的方法吗?如果是的话,我如何将字典分解为每个站点的列表?在</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<pre><code>s1 = "ATCGACAG" s2 = "ACCGACG" alignment = [s1[i] if s1[i] == s2[i] else "-" for i in range(len(min([s1,s2],key=len)))] print "".join(alignment) A-CGAC- </code></pre>
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