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如何解决带有“未识别参数”的错误?
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<p>我写了一个python脚本(在我朋友的帮助下),它允许我:</p> <p><code>1. Search multiple directories for files with the identical names 2. <a href="https://www.cnpython.com/list/append" class="inner-link">append</a> the absolute path to the name of the file 3. Add all the files to one directory</code></p> <p>这样做是为了避免在使用cp命令时文件被覆盖。在</p> <p>最近我尝试过使用脚本,但现在遇到了如下错误:</p> <p>代码:<code>python ~/gatherfiles.py —outdir protein_files —trgfile ./*/protein.faa</code></p> <p>错误: <code>gatherfiles.py: error: unrecognized arguments: ./GCF_000374525.1_ASM37452v1_genomic.fna_dfast/protein.faa ./GCF_000463742_ASM94337v1_genomic.fna_dfast/protein.faa ./GCF_...etc. </code> 有人知道如何克服这个问题吗?在</p> <p>以下是实际脚本:</p> <pre><code>_all__ = ['gatherfiles'] import os import glob import shutil import argparse def gatherfiles(outdirpath, trgfilename): """ Args: - outdirpath (str): A path to output directory. - trgfilename (str): A name of target file. Escape sequence is available (eg. '*.txt'). """ # make output dir os.makedirs(outdirpath, exist_ok=True) # search target file paths = glob.glob(trgfilename, recursive=True) for path in paths: dname = os.path.dirname(path).split('/')[-1] fname = path.split('/')[-1] shutil.copyfile(path, os.path.join(outdirpath,dname+'_'+fname)) if __name__ == '__main__': parser = argparse.ArgumentParser(formatter_class=argparse.ArgumentDefaultsHelpFormatter) parser.add_argument('--outdir', type=str, required=True, help='path to output directory.') parser.add_argument('--trgfile', type=str, required=True, help='name of target file.') opt = parser.parse_args() gatherfiles(opt.outdir, opt.trgfile) </code></pre> <p>我希望新命名的文件存储在输出文件中,而不会被对方覆盖。在</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>解析器的参数<code> trgfile</code>接受一个字符串。 但您使用通配符调用脚本:<code>—trgfile ./*/protein.faa</code>。在</p> <p>然后将此通配符计算为多个字符串,因此出现无法识别的参数错误。在</p> <p>更改trgfile以接受多个值(add<code>nargs='+'</code>),或者使用单个trgfile调用脚本。在</p>
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