使用h5py删除hdf5数据集

Question

有没有办法从hdf5文件中删除数据集，最好使用h5py？或者，是否可以覆盖一个数据集，同时保持其他数据集的完整性？

据我所知，h5py可以在5种模式下读/写hdf5文件

f = h5py.File("filename.hdf5",'mode')

其中模式可以是r用于读取，r+用于读写，a用于读写，但如果不存在则创建新文件，w用于写入/覆盖，以及w-，与w相同，但如果文件已存在则失败。我已经试过了，但似乎没有成功。

任何建议都非常感谢。

Answer 1

我试过了，唯一能真正减小文件大小的方法是将所有内容复制到一个新文件中，然后去掉我不感兴趣的数据集：

fs = h5py.File('WFA.h5', 'r')
fd = h5py.File('WFA_red.h5', 'w')
for a in fs.attrs:
    fd.attrs[a] = fs.attrs[a]
for d in fs:
    if not 'SFS_TRANSITION' in d: fs.copy(d, fd)

Answer 2

我不明白你的问题和文件打开模式有什么关系。因为读/写r+是一条路。

据我所知，删除是不容易的/不可能的，尤其是不管你做什么，文件大小都不会缩小。

但覆盖内容没问题

f['mydataset'][:] = 0

Answer 3

是的，这是可以做到的。

with h5py.File(input,  "a") as f:
    del f[datasetname]

您需要以可写模式打开文件，例如append（如上所述）或write。

正如@seppo enarvi在注释中指出的，先前推荐的f.__delitem__(datasetname)函数的目的是实现del运算符，以便可以使用del f[datasetname]删除数据集