使用pythonigraph编写带有节点标签的Pajek文件

Question

我使用igraph构造图，并将它们写成Pajek（.net）文件，以便与其他程序一起使用。Pajek文件是用顶点的数字索引而不是顶点标签来编写的，所以当我把这些文件读入另一个程序时，标签就消失了。在

下面是一个简单的例子：

>>> g = ig.Graph(vertex_attrs={'label': ['spam', 'eggs', 'ham']}, edges=[(1,0), (1,2)])
>>> g.vs.get_attribute_values('label')
['spam', 'eggs', 'ham']
>>> g.write_pajek('file.net')

$ head file.net
*Vertices 3
*Edges
1 2
2 3

是否可以更改write_pajek()的行为来写出标签而不仅仅是索引？在

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一位好心的同事指出，igraphC库doesn't have能够写出顶点标签。在

以下是解决方法：

^{pr2}$

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更新

不需要解决方法！感谢Gabor指出write_pajek()使用的是id属性，而不是{}属性。在

>>> g.vs['id'] = g.vs['label'] 
>>> g.write_pajek('igfile.net') 

$ head igfile.net 
*Vertices 3 
1 "spam" 
2 "eggs" 
3 "ham" 
*Edges 
1 2 
2 3

Answer 1

你的同事很好，但他还是错了。：）要设置的右属性称为id：

g = ig.Graph(vertex_attrs={'id': ['spam', 'eggs', 'ham']}, edges=[(1,0), (1,2)])

（实际上我没有在Python中尝试过，因为我在安装pythonigraph时遇到了困难。但它在R中工作得很好，而且它们调用的是相同的C代码，所以我99%肯定它在Python中也能工作。你能试试吗？）在