擅长:python、mysql、java
<p>实现矩阵的一种方法是读取文件的内容并将其转换为一个列表,其中列表的每个元素都是每个元素中存在的序列线路。和然后你可以访问你的矩阵作为一个二维数据结构。
例如:【ATCGCTANANAGCTANANAGCTANAGTAGCTAANACGAGAGAGACTATAGC,ATCGCTANAGCTANAGTAANAGCACTAGATAGTAGC,ATCGCTANANAGCTANANAGCAGCTAANACGAGAGAGACTATAGC,ATCGCTANAGCTANANAGCTANAGCACTAGATAGTAGC,ATCGCTANAGCTANANAGCAGCTAGACTAGATAGC】</p>
<pre><code>filePath = "file path containing the sequence"
</code></pre>
<p>将序列存储为矩阵的列表</p>
^{pr2}$
<p>另一种访问矩阵中每个元素的方法</p>
<pre><code>for seq in range(len(listFasta)):
for ch in range(len(listFasta[seq])):
print listFasta[seq][ch]
</code></pre>