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如何在一个python中将多个fastmark转换为多个fastmark?
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<p>我有一个像这样的文件(txt或fasta)。每个序列只位于一行中。</p> <pre><code> >Line1 ATCGCGCTANANAGCTANANAGCTAGANCACGATAGAGAGAGACTATAGC >Line2 ATTGCGCTANANAGCTANANCGATAGANCACGAAAGAGATAGACTATAGC >Line3 ATCGCGCTANANAGCTANANGGCTAGANCNCGAAAGNGATAGACTATAGC >Line4 ATTGCGCTANANAGCTANANGGATAGANCACGAGAGAGATAGACTATAGC >Line5 ATTGCGCTANANAGCTANANCGATAGANCACGATNGAGATAGACTATAGC </code></pre> <p>我要得到一个矩阵,其中每个位置对应于序列的每个字母(核苷酸)。在本例中,矩阵为(5x50)。 我一直在研究新方法。我希望有人能帮我。</p>
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1 个回答
匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>我希望这段简短的代码能有所帮助。基本上需要将字符串拆分为一个字符数组。然后你就把所有的东西都放到矩阵里。在</p> <pre><code>Line1 = "ATGC" Line2 = "GCTA" Matr1 = np.matrix([n for n in Line1], [n for n in Line2]) </code></pre> <p><code>Matr1[0,0]</code>将返回矩阵中的第一个元素。在</p>
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