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Networkx parse gml写入不可用的gml文件
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<p>我一直试图在networkx gml中解析一些附加属性,以便以后使用,但遇到了一个问题。在</p> <p>当从Cytoscape获得gml文件时,networkx输出它自己无法读取的gml文件。在</p> <p>即Cytoscape->;Into networkx->;Output->;Into networkx->;错误:</p> <pre><code>pyparsing.ParseException: Expected "]" (at char 1116756), (line:71732, col:3) </code></pre> <p>现在,错误请求在节点后面再加一个]的值(也就是说让图形忽略边),如果这样做,图形就会工作。但是,它不再有任何边。在</p> <p>为了充分测试这一点,我做了“Cytoscape->;Into networkx->Output”,根本不更改代码,只需:</p> ^{pr2}$ <p>然后读到:</p> <pre><code>BasicGraph = nx.read_gml("KeggCompleteEng.gml", relabel = True) </code></pre> <p>误差仍然是可重复的。所以我假设这与networkx如何编写gml文件有关。在</p> <p>我使用的两个文件是:</p> <ul> <li><a href="https://www.dropbox.com/s/nxgsrziy01dvo6l/KeggComplete.gml" rel="nofollow">Original from Cytoscape</a></li> <li><a href="https://www.dropbox.com/s/5tsai9tf08r6vr4/KeggCompleteEngempty.gml" rel="nofollow">Networkx output</a></li> </ul> <p>如果有人能对为什么会发生这样的事情有一些了解,我们将不胜感激!在</p>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>这是NetworkX中生成嵌套属性(本例中为边缘图形数据)时的一个错误。 额外的一组引号错误地添加到“Line”属性中。在</p> <p>修复程序已合并为此请求的一部分: <a href="https://github.com/networkx/networkx/pull/981" rel="nofollow">https://github.com/networkx/networkx/pull/981</a></p>
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