如何使用正则表达式查找文件中出现的所有“CD”？

Question

我正试图通过我的文件查找它显示“CD”的总次数，我想使用正则表达式来实现这一点。我是python新手，想尝试一下

我试着使用re.findall（r'CDS'），但它不起作用

我的文件示例如下：

gene            10887..10960
                     /gene="ileT"
     CDS            10887..10960
                     /gene="ileT"
                     /product="tRNA-Ile"
                     /note="codon recognized: AUC; ileT, tRNA-Ile, anticodon
                     gat, length = 74"
                     /anticodon=(pos:10921..10923,aa:Ile,seq:gat)
     gene            11112..11184
                     /gene="alaT"
     CDS            11112..11184
                     /gene="alaT"

所以在这里，我期望2

我不确定我做错了什么：任何帮助都是了不起的

Answer 1

re.findall()第一个参数应该是您正在查找的模式，第二个参数应该是您正在查找的string（文件）

应该是这样的：

occurences = re.findall('CDS', yourFile)

Here is a helpful resource with some examples