需要计算有DNA序列的.txt文件中“AGAT”、“AATG”和“TATC”重复的次数

Question

这是我的第一个编码类，每次DNA序列中出现一个给定值时，我都很难让计数器增加

到目前为止，我的代码是：

agat_Counter = 0
aatg_Counter= 0
tatc_Counter= 0
DNAsample = open('DNA SEQUENCE FILE.txt', 'r');
for lines in DNAsample:
    if lines in DNAsample=='AGAT':
        agat_Counter+=1
    else:
        agat_Counter+=0
print(agat_Counter)
    
for lines in DNAsample:
    if lines in DNAsample=='AATG':
        aatg_Counter+=1
    else:
        aatg_Counter+=0
print(aatg_Counter)
for lines in DNAsample:
    if lines in DNAsample=='TATC':
        tatc_Counter+=0
    else:
        tatc_Counter+=0
print(tatc_Counter)

Answer 1

你可以用很多方法做到这一点。其中一个更简单的方法是：

DNAsample = open('DNA SEQUENCE FILE.txt', 'r').read()
agat_Counter = DNAsample.count('AGAT')
aatg_Counter= DNAsample.count('AATG')
tatc_Counter= DNAsample.count('TATC')