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安装mpi4py时出现MPICC错误,尽管MPICC安装正确且正常
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<p>我已经在Ubuntu12.04上成功地安装了MPICH,可以让简单的testc程序按预期编译和运行。在</p> <p>现在我尝试使用pip安装mpi4py,只需通过<code>pip install mpi4py</code>。我首先执行了<code>sudo apt-get build-dep python-mpi4py</code>,它工作得很好。在</p> <p>我使用的是virtualenv,所以这个mpi4py安装不在sudo中(也不应该)。在</p> <p>下面是我在一组冗长的控制台输出之后遇到的命令和错误,这些输出看起来像是正常的编译内容(如果需要,我可以打印控制台输出的所有<em>所有</em>,但我认为大部分是标准编译器警告,表示没有问题)。在</p> <pre><code>(local-dev)espears@espears-w:~$ pip install mpi4py src/ext/mpi_swig.c: In function ‘SWIG_Python_AddErrorMsg’: src/ext/mpi_swig.c:859:5: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security] cc1: some warnings being treated as errors error: command '/usr/bin/mpicc' failed with exit status 1 ---------------------------------------- Cleaning up... Command /home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-5o6OwN-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /home/espears/.virtualenvs/local-dev/include/site/python2.7 failed with error code 1 in /home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py Traceback (most recent call last): File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/pip", line 11, in <module> sys.exit(main()) File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/__init__.py", line 185, in main return command.main(cmd_args) File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 161, in main text = '\n'.join(complete_log) UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xe2 in position 31: ordinal not in range(128) </code></pre> <p>但是,<code>which mpicc</code>给出了预期的结果:<code>/usr/bin/mpicc</code>,如上所述,如果我使用这个<code>mpicc</code>来编译简单的.c测试程序,它们工作得很好。在</p> <p>我看到一些链接描述了一个用于编译MPI的标志选项<code>fPIC</code>,但是,我只是使用apt-get来安装MPI,并且特别希望这些工具只依赖于本机的Ubuntu包,而不是维护单独的安装说明来手动构建它们。在</p> <p>如何确定<code>mpicc</code>在<code>mpi4py</code>安装过程中失败的原因?在</p> <p><strong>添加</strong></p> <p>以下来自控制台输出的命令似乎是导致问题的编译命令。在</p> ^{pr2}$ <p>当我自己从命令行尝试时,会出现以下错误:</p> <pre><code>(local-dev)espears@espears-w:~$ /usr/bin/mpicc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c src/ext/mpi_swig.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/ext/mpi_swig.o gcc: error: src/ext/mpi_swig.c: No such file or directory gcc: fatal error: no input files compilation terminated. </code></pre>
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匿名
1天前
擅长:python、mysql、java
<p>我只需将pip指向MPI4PY包的url,而不是包名,就可以成功地解决这个问题,而不需要更改系统中的任何内容:</p> <pre><code>pip install https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py/downloads/mpi4py-1.3.1.tar.gz </code></pre>
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