在Python中比较两个列表的有效方法（从R代码转换）

Question

我正在为基因组数据编写一个转换矩阵计算器。我有两个单核苷酸多态性列表：previousState和currentState。我的文件中还有一个独特的核苷酸列表：uniqueSNPs

我正在尝试转换R中的嵌套for循环：

for (i in 1 : nstate) { totalNucleotides = sum(previousState == uniqueSNPs[i]) for (j in 1 : nstate) { matches = sum(previousState == uniqueSNPs[i] & previousState == uniqueSNPs[j]) tran.mat[i, j] = matches / totalNucleotides } }

其中nstate就是uniqueSNPs的长度

除了Python中的matches计算之外，我已经把所有的东西都计算好了。我迄今为止的做法是：

for i in range(0, len(uniqueSNPs)):
    totalNucleotides = previousState.count(uniqueSNPs[i])
    for j in range(0, len(uniqueSNPs)):
        matches = sum((previousState == uniqueSNPs[i]) & 
            (currentState == uniqueSNPs[j]))
        mat[i,j] = matches / totalNucleotides

但是，我在计算matches的行上得到一个错误，它表示 TypeError: 'bool' object is not iterable。 我想知道是否有一种方法可以用Python以简洁高效的方式编写这行代码？我对Python编程比较陌生，所以我不知道有什么好的技巧

谢谢