一个lin中的re.finditer（R或K，但不是RP或KP）

Question

我想在子字符串中有P或K的索引，但不是PR或PK。现在，我可以编写两行代码，但它比使用for循环和if要慢。我想要一个带re.finditer的非常快的，可以吗

proseq = "NSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWWELRP"
xxx = [m.start() for m in re.finditer('(R|K)', proseq)]
yyy = [m.start() for m in re.finditer('(RP|KP)', proseq)]
print list(set(xxx)^set(yyy))
OUT> [40, 27, 44, 47]

比我的更快的for循环（它被排序）

proseq = "NSDSECPLSHDGYCLHDGVCMYIEALDKYACNCVVGYIGERCQYRDLKWWELPR"
cut_sites=[]
for i in range(0,len(proseq)):
    if proseq[i]=='K' and proseq[i+1]!='P':
        cut_sites.append(i)
    elif proseq[i]=='R' and proseq[i+1]!='P':
        cut_sites.append(i)
OUT> [27, 40, 44, 47]

其他快速方式也很受欢迎

Answer 1

使用regex (R|K)([^P]|$)。这可以自由读取为“R或K，后跟一个不是P的字符（[^P]），或者字符串的结尾（$）”

Thid regex实际上会给你结果，而无需再次检查