如何正确使用cmd.transform\u selection（）

Question

我有一组3x3旋转矩阵和一组对应的配体姿势的平移向量。我一直在尝试实现一个python方法，其中我将一个姿势转换为它的原点，应用一个旋转矩阵，将姿势转换为它的原始位置，然后应用转换向量。目前，我一直在尝试实现pymolapi命令：cmd.transform_selection()，它接受一个选择和一个"ttt"PyMOL矩阵（https://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection）

我目前的做法如下：

1.）从原始姿势（orig_pose）中，我使用ProDy函数来获得坐标（org_coords）

2.）我计算中心center = np.mean(org_coords, axis=0)，其中中心是[x, y, z]矩阵

3.）然后使用cmd.translate()和orig_pose作为选择，使用-center作为翻译向量

4.）然后我想应用我的旋转矩阵并将其格式化为'ttt'矩阵（例如[m0, m1, m2, 0, m4, m5, m6, 0, m8, m9, m10, 0, m12, m13, m14, 1]；参见：https://pymolwiki.org/index.php/Transform_selection）。不过，它似乎也应用了这种姿势的翻译

有没有人有使用这个API命令的经验，或者遇到过一种方法让我在给定输入的情况下变换对象（3x3旋转矩阵和平移向量）？非常感谢您的帮助，谢谢