我有一个名为test.txt
的文本文件。我想用这个文本文件做一个表格。我是python新手,如果有人能帮我解决这个问题,我会非常感激。你知道吗
你知道吗测试.txt你知道吗
Counting********************File: bbduk_trimmed_Ago2_SsHV2L_1_CATGGC_L003_R1_001.fastq
Seq_132582_1: ATCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTCT:
0
Seq_483974_49238: TCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTC:
73764
Counting********************File: bbduk_trimmed_Ago2_SsHV2L_2_CATTTT_L003_R1_001.fastq
Seq_132582_1: ATCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTCT:
0
Seq_483974_49238: TCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTC:
78640
Counting********************File: bbduk_trimmed_Ago2_VF_1_CAACTA_L003_R1_001.fastq
Seq_132582_1: ATCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTCT:
0
Seq_483974_49238: TCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTC:
26267
我试过的代码:
pattern1 = re.compile(r'bbduk_trimmed')
pattern2 = re.compile(r'Seq_132582_1: ATCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTCT')
pattern3 = re.compile(r'Seq_483974_49238: TCCGAATTAGTGTAGGGGTTAACATAACTC:')
l1 = []
l2 = []
l3 = []
with open('test.txt') as f:
for i in f:
if pattern1.search(i):
a = re.sub('\n','',i)
l1.append(a)
elif pattern2.search(i):
a = re.sub('\n','',i)
l2.append(a)
elif pattern3.search(i):
a = re.sub('Query:','',i)
b = re.sub('\n','',a)
l3.append(b)
output = zip(l1,l2,l3)
print (output)
我想要的结果:
FileName Seq_132582_1 Seq_483974_49238
bbduk_trimmed_Ago2_SsHV2L_1_CATGGC_L003_R1_001.fastq 0 73764
bbduk_trimmed_Ago2_SsHV2L_2_CATTTT_L003_R1_001.fastq 0 78640
bbduk_trimmed_Ago2_VF_1_CAACTA_L003_R1_001.fastq 0 26267
更新时间: 你可以把它当作一个单独的表达式来尝试。你知道吗
这将产生以下输出![Output](https://i.stack.imgur.com/WayDw.png)
如果需要,可以将结果转换为数据帧。你知道吗
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