可视化VCF元数据的工具包。
vcfViewer的Python项目详细描述
#VCFviewer公司 可视化变量调用格式(VCF)文件数据的工具包。
由Tom Sasani为犹他大学的MDCRC 6521开发。
##关于
vcfviewer是一个基本的工具包,允许用户在[bokeh](http://bokeh.pydata.org/en/latest/)中创建有用的vcf元数据可视化。例如,用户可以绘制质量分数,
##用法
要直观地确定VCF中哪些变体满足质量分数阈值,只需运行:
python plot_qual.py[vcf][threshold]
##依赖关系
bokeh
要安装,请运行conda install bokeh。
cyvcf2
要安装,请运行pip install cyvcf2。