可视化VCF元数据的工具包。

vcfViewer的Python项目详细描述


#VCFviewer公司 可视化变量调用格式(VCF)文件数据的工具包。

由Tom Sasani为犹他大学的MDCRC 6521开发。

##关于

vcfviewer是一个基本的工具包,允许用户在[bokeh](http://bokeh.pydata.org/en/latest/)中创建有用的vcf元数据可视化。例如,用户可以绘制质量分数,

##用法

要直观地确定VCF中哪些变体满足质量分数阈值,只需运行:

python plot_qual.py[vcf][threshold]

##依赖关系

bokeh

要安装,请运行conda install bokeh。

cyvcf2

要安装,请运行pip install cyvcf2。

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