从树序列拓扑推断节点年龄

tsdate的Python项目详细描述


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tsdate是一种可伸缩的方法,用于估计 tree sequence。该方法使用联合先验,并根据树序列的每一个边缘上的突变数(即使用“分子钟”)来更新节点时间。在

该方法被设计为对tsinfer的输出进行操作,该输出可以有效地从大型遗传数据集推断出树序列拓扑结构。在

有关安装和使用软件的信息,请参阅documentation。在

注:此文档目前正在开发中。请等待在您已出版的作品中使用tsdate,直到我们的预印本发行。在

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