从树序列拓扑推断节点年龄
tsdate的Python项目详细描述
tsdate
是一种可伸缩的方法,用于估计
tree sequence。该方法使用联合先验,并根据树序列的每一个边缘上的突变数(即使用“分子钟”)来更新节点时间。在
该方法被设计为对tsinfer的输出进行操作,该输出可以有效地从大型遗传数据集推断出树序列拓扑结构。在
有关安装和使用软件的信息,请参阅documentation。在
注:此文档目前正在开发中。请等待在您已出版的作品中使用tsdate
,直到我们的预印本发行。在
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