火炬。Pythorch分子动力学
torchmd的Python项目详细描述
火炬
关于
TorchMD打算提供一个简单易用的API来使用PyTorch来执行分子动力学。这使得研究人员能够更快速地进行力场开发的研究,并将神经网络的潜力无缝地集成到动力学中,具有Pythorch的简单和强大功能。在
TorchMD目前是WIP,因此请随时提供有关API或GitHub问题跟踪程序中潜在错误的反馈。在
安装
我们建议在新的python环境中安装TorchMD,最好是通过Miniconda包管理器。在
conda create -n torchmd
conda activate torchmd
conda install pytorch torchvision cudatoolkit=10.1 -c pytorch
conda install pyyaml ipython
pip install torchmd
示例
在examples
文件夹中可以找到关于如何使用TorchMD执行动力学的各种示例。在
致谢
我们要感谢陈扎克伯格倡议和Acellera为支持这一项目提供的资金。这个项目现在将与openMM(www.openmm.org)和acemd(www.acellera.com/acemd)合作开发。在
- 项目
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