stochpy:python中的随机建模
Stoch的Python项目详细描述
stochpy(随机建模在python中)是一个易于使用的软件包,它提供了几种随机模拟算法(ssas),可用于以随机方式模拟生化系统。此外,Stochpy还提供了几种独特且易于使用的分析技术。此外,如果安装了足够的库,stochpy完全支持sbml输入。
s s a试图描述一个反应系统的时间演化,这样它就考虑了离散性和随机性。离散性和随机性在生化系统中起着重要作用。因此,ssa被广泛用于模拟生化系统。尤其是对于含有低拷贝数的生化系统。对于这样的系统,确定性模型往往无法捕捉系统的随机性,而ssas则能够捕捉这种随机行为。
Stochpy是脓肿的延伸。pysces是用于蜂窝系统的python模拟器,是一个用于分析和研究蜂窝系统的工具包。
Stochpy的功能:
- 随机模拟(也包括延迟模拟)
- 复杂的分析技术
- 可用作库
- 接受sbml和pysces输入
- 多平台
- 用户友好