空间多层次模型拟合与收敛性诊断

spvcm的Python项目详细描述


https://travis-ci.org/pysal/spvcm.svg?branch=masterhttps://zenodo.org/badge/79168765.svg

这是一个估计空间相关方差分量模型/可变截距模型的包。除了用python进行gibbs采样的通用工具包外,该包还提供了pymc3和coda的接口。有关完整的概述,请参阅walkthrough

作者:列维·约翰·沃尔夫

电子邮件levi.john.wolf@gmail.com

机构:布里斯托尔大学和芝加哥大学空间数据科学中心

preprint:在Open Science Framework

安装

这个包在Python3.5中工作得最好,但是单元测试在Python2.7中也通过了。 官方只支持Python3.5+。

要安装,首先从continuumAnalytics安装anaconda pythonDistribution。该软件包的安装已经在windows(10,8,7)mac osx(10.8+)和linux中使用anaconda 4.2.0和python 3.5版进行了测试。

安装anaconda之后,可以使用python包管理器pip安装spvcm

pip install spvcm

若要从源安装,还可以导航到源目录并使用:

pip install ./

它将从目标源目录安装包。

用法

要使用包,请启动python解释器并运行: import spvcm.api as spvcm

然后,许多不同的方差分量模型细节可在:

spvcm.bothspvcm.upperspvcm.lower

有关更详细的说明,请参阅jupyter笔记本using the sampler.ipynb,该笔记本位于spvcm/examples目录中。

引文

列维·约翰·沃尔夫。(2016年)。一类空间相关方差分量模型的gibbs抽样。芝加哥大学空间数据科学技术中心报告。

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