可视化雪坑的python项目
snowpyt的Python项目详细描述
snowpyt:在python中可视化snowpits的开源库
Simon Filhol,2016年11月,麻省理工学院许可条款下的版权,请参见license.txt文件
上次修改时间:2018年3月(或参见github文件历史记录中的日期)
请随意为项目做贡献!!!!可以添加许多新功能…
待办事项:
高优先级
- 编写函数以保存pit并将其加载到pickle格式(当前不工作)
- 使地面看起来像是确认坑到达地面的用户。添加有关地面类型的注释。
低优先级
- 指定体形大小并调整相应的字体大小
- 更好地呈现medatadata文本,将日期转换为可读日期
- 选择将图形大小调整为所需大小和dpi。如果需要(即多个样本) ,返回轴从绘图函数变为更高级的绘图。
- 添加选项以pickle格式或csv保存坑
- 添加选项以matplotlib格式保存图形
- 在给定多个示例列时添加绘图选项。
目标
这个库的目的是为雪坑数据提供可视化工具。 从斯瓦尔巴雪地研究小组的需要开始,这个包应该进化 包括更多的雪坑类型和可视化方案。
雪谷分类遵循联合国教科文组织提供的指南 International Classification for Seasonal Snow on the Ground (Fierz等人,2009年)
Fierz,C.,Amstrong,R.L.,Durand,Y.,Etchevers,P.,Greene,E.,McClung,D.M.,Nishimura,K.,Satyawali,P.K.和Sokratov,S.A.2009。地面季节性雪的国际分类。IHP-VII技术文件 水文N°83,IACS贡献N°1,UNESCO-IHP,巴黎。
安装
来自pypi存储库的最后一个稳定版本
只需在终端中运行以下命令:
pip install snowpyt
参与项目的最新开发版本:
使用终端中的以下命令将github存储库克隆到本地目录
git clone https://github.com/ArcticSnow/snowpyt.git
或者下载软件包
分支“master”由最新的稳定版本组成。其他开发版本包含在其他git分支中。
如果满足库的要求,包中包含了绘制snowpyt的所有函数。它还包含测试库的数据样本。如果您还可以按照以下步骤根据自己的方便修改代码,请向我们发送消息以添加为参与者:
要使用开发版本并继续使用最新的更改,请按以下步骤安装它
pip install -e [path2folder/snowpyt]
要将最新更改上载到pypi.org,只需:
- 更改文件中的版本号
snowpyt/__version__.py
- 从snowpyt文件夹的终端运行,前提是您的
$HOME/.pyc
设置正确:
python setup.py upload
要求
python 2.7.9具有以下库:
- numpy
- matplotlib
- pandas
- xlrd
- xlm
使用
将数据导入snowpyt有三种方法:
使用https://niviz.org/数字化您的雪坑,并将您的雪坑导出为caamlv6(此格式遵循雪坑的国际标准)。它们使用import_caamlv6()函数。
有关CAAML format的详细信息
使用excel file example here中的excel文件模板将雪坑数字化。以.xslx格式(默认excel格式)保存excel或libreoffice文件。
直接向snowpit类对象输入数据
示例:
fromsnowpytimportpit_classaspc############################################################# Example 1 - using a caamlv6 file:p=pc.Snowpit()p.caaml_file='[PATH TO YOUR FILE].caaml'p.import_caamlv6()p.plot(plot_order=['density','temperature','stratigraphy','hardness'])p.plot(metadata=True)p.plot(plot_order=['density','temperature','stratigraphy','crystal size'])# import isotope values (dD, dO18, d-ex)p.sample_file='[PATH TO YOUR FILE].csv'p.import_sample_csv()p.plot(plot_order=['dD','d18O','d-ex','hardness'])
同位素.csv
文件应遵循以下格式:
number,height_top,height_bot,dD,d18O,dxs,ice_type
0,94,93.0,-57.55,-8.16,7.73,S
1,93,89.8,-61.56,-8.76,8.54,S
2,89.8,86.6,-75.45,-10.64,9.68,S
- 所有数据表都作为pandas数据帧或snowpyt类对象中的numpy数组加载
在python控制台中键入以下内容以查看加载的数据表:
mypit.table
这允许自定义plotti在现有绘图功能
之上使用您选择的库- 额外采样值
可以将额外的示例值列添加到Excel文件中。列名必须唯一
当前的打印函数不会打印这些额外的列,只打印第一列。但是,这些值是通过表格中的pandas作为数据帧加载的(请参见5.)
想做贡献吗?
将项目克隆到主目录后,创建一个git分支,就可以了。编辑稳定后,与主分支合并。请参阅关于git分支和合并的简洁教程,here
贡献者列表
- 西蒙·菲尔霍尔
- 纪尧姆·萨特
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