相似网络融合(SNF)python实现
snf-simple的Python项目详细描述
相似网络融合
SNF python实现,意图是使用matlabv2.1实现1-2
参考文献:
B Wang, A Mezlini, F Demir, M Fiume, T Zu, M Brudno, B Haibe-Kains, A Goldenberg (2014) Similarity Network Fusion: a fast and effective method to aggregate multiple data types on a genome wide scale. Nature Methods. Online. Jan 26, 2014
使用
从pypi安装:
pip install snf_simple
使用模块
您可以在demo下看到一个用法示例
发展
该项目正在使用poetry进行可靠的开发。在
有关如何为您的系统安装最新版本,请参阅诗歌文档:
设置
安装诗歌后,启动一个环境:
^{pr2}$如果您使用的是PyCharm,那么可以使用this plugin来设置解释器。在
测试
测试使用标准的pytest
格式。安装完成后,您可以使用以下命令运行它们:
pytest
- 项目
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