单细胞图像分析软件包
scimap的Python项目详细描述
单细胞图像分析软件包
Scimap是一个可扩展的工具包，用于分析单细胞多重成像数据。该软件包使用了anndata框架，使得它很容易与其他流行的单单元分析工具包（如scanpy）集成。它包括空间可视化、空间聚类分析、空间聚类分析。基于Python的实现有效地处理超过一百万个单元的数据集。在
安装
我们强烈建议在新的虚拟环境中安装scimap。在
# If you have conda installed
conda create --name scimap python=3.7
conda activate scimap
将scimap直接安装到激活的虚拟环境中：
安装后，软件包可以导入为：
$python>>>importscimapassm
开始吧
提供scimap函数和教程的详细文档here。
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