量子化学基础。
qcelemental的Python项目详细描述
QCelemental
qcelumne是一个包含物理的量子化学资源模块 来自NIST和分子处理器的常数和周期表数据。
周期表和物理常数数据来自NIST SRD144和 SRD121,分别(details)以可更新的方式 (NIST发布的JSON文件周围的类)。
这个项目还包含一个用于Molecule QCSchema的生成器、验证器和转换器。
周期表
几乎可以使用任何别名获得各种周期表数量:
>>>importqcelementalasqcel>>>qcel.periodictable.to_E('KRYPTON')'Kr'>>>qcel.periodictable.to_element(36)'Krypton'>>>qcel.periodictable.to_Z('kr84')36>>>qcel.periodictable.to_A('Kr')84>>>qcel.periodictable.to_A('D')2>>>qcel.periodictable.to_mass('kr',return_decimal=True)Decimal('83.9114977282')>>>qcel.periodictable.to_mass('kr84')83.9114977282>>>qcel.periodictable.to_mass('Kr86')85.9106106269
物理常数
物理常数可以直接从NIST CODATA:
>>>importqcelementalasqcel>>>qcel.constants.Hartree_energy_in_eV27.21138602>>>qcel.constants.get('hartree ENERGY in ev')27.21138602>>>pc=qcel.constants.get('hartree ENERGY in ev',return_tuple=True)>>>pc.lbl'Hartree energy in eV'>>>pc.dataDecimal('27.21138602')>>>pc.units'eV'>>>pc.comment'uncertainty=0.000 000 17'
或者,使用Pint unit conversion package,任意 可获得换算系数:
>>>qcel.constants.conversion_factor("bohr","miles")3.2881547429884475e-14
共价半径
共价半径可用于Alvarez, Dalton Transactions (2008) doi:10.1039/b801115j中的大多数周期表。
>>>importqcelementalasqcel>>>qcel.covalentradii.get('I')2.626719314386381>>>qcel.covalentradii.get('I',units='angstrom')1.39>>>qcel.covalentradii.get(116)Traceback(mostrecentcalllast):...qcelemental.exceptions.DataUnavailableError:('covalent radius','Lv')>>>qcel.covalentradii.get(116,missing=4.0)4.0>>>qcel.covalentradii.get('iodine',return_tuple=True).to_dict(){'label':'I','units':'angstrom','data':Decimal('1.39')}