TNG轨迹库的最小Cython包装器

pytng的Python项目详细描述


https://travis-ci.com/MDAnalysis/pytng.svg?branch=masterhttps://codecov.io/gh/MDAnalysis/pytng/branch/master/graph/badge.svghttps://zenodo.org/badge/92180386.svg

此包提供TNGFileIterator对象以允许简单Pythonic 访问TNG文件中包含的数据。在

importpytngimportnumpyasnpwithpytng.TNGFileIterator('traj.tng','r')astng:positions=np.empty(shape=(tng.n_atoms,3),dtype=np.float32)fortsintng:time=ts.get_time()positions=ts.get_positions(positions)

这个包包含到libtng的TNG文件格式[1][2]的Python绑定。 这被分子模拟程序(如Gromacs)用来存储 拓扑结构和分子动力学模拟结果。在

警告

这个软件包正在积极开发中。API可能会更改 发布版本之间。在

安装

要使用pip安装,只需运行

^{pr2}$

要从源代码安装最新的开发版本,请运行

git clone git@github.com:MDAnalysis/pytng.git
cd pytng
python setup.py install

寻求帮助

有关使用此库的帮助,请访问GitHub issue tracker。在

欢迎加入QQ群-->: 979659372 Python中文网_新手群

推荐PyPI第三方库


热门话题
安卓为什么Java AudioEffect不支持双簧管?   增加内存后出现java IntelliJ堆大小错误   在unix/linux中工作的java中将unicode字符串转换为ASCII   java是否缺少正确对齐输出的值?   java Spring 3 MVC:动态表单中的onetomany(创建/更新时添加/删除)   java在接口中创建两个通用参数   lambda使用Java 8从嵌套列表中使用forEach查找项的替代方法是什么?   Java正则表达式匹配10位电话号码,中间有空格   linux将log4j外部化。使用命令行Java的属性文件   带有SSL的java简单RMI服务器   java无法为事务[…]打开JPA EntityManager无法获取驱动程序类“null”和URL“null”的连接   Android设备上的java Oauth Foursquare   for循环的ImageButton名称的java骰子模拟浓缩   java有没有简单的1d条形码阅读器?   如何在调用resultset后解决“无效字符串或缓冲区长度”。从java到访问mdb的getString()连接   在Java8中,是否可以使用JVM参数来控制何时(或在什么条件下)卸载类?