一套扩散分析算法。
pysda的Python项目详细描述
Pysda
用于扩散分析的python套件（用于python 3.5及更高版本）
简介
该软件包目前包括两种扩散分析算法：
- tapitas：一种探索时空扩散级数结构的地理计算算法。科学报告。 https://www.nature.com/articles/s41598-017-12852-z
- mst-dbscan：疾病聚类扩散动力学特征：一种改进的时空dbscan（mst-dbscan）算法。美国地理学家协会年鉴。 https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/24694452.2017.1407630
安装
您可以选择以下选项之一将pysda安装到您的python环境中。
一。下载然后pip安装
单击绿色按钮（克隆或下载）下载包，选择下载zip。
将zip文件解压缩到工作目录
在CMD中（您可以使用PIP安装到预期的Python环境）：
cd C://the/extract/directory/pysda-master pip install .
这将把包安装到python中。
2.git克隆和pip安装
在命令中：
cd C://a/place/you/like/ git clone https://github.com/wenlab501/pysda.git cd pysda pip install .
这实际上和第一个选项完全一样。
三。从github安装pip
在命令中：
pip install git+https://github.com/wenlab501/pysda.git
这也和上面一样。
四。从pypi安装pip
在命令中：
pip install pysda
这将从pypi下载pysda。
依赖性
- Pandas，Geopandas：用于数据处理和结果准备
- shapely:处理几何图形
- 笛卡尔，matplotlib，肖伯恩：用于制作地图
- python dateutil：处理日期转换
- imageio:动画人物导出
- tapitas：tapitas的核心算法
- mst dbscan:mst-dbscan的核心算法
教程
- 在Pysda中使用tapitas的教程： https://github.com/wenlab501/pysda/blob/master/pysda-taipitas-tutorial.ipynb
- Pysda中使用mst-dbscan的教程： https://github.com/wenlab501/pysda/blob/master/pysda-mstdbscan%20tutorial.ipynb
许可证
版权所有（c）台湾国立大学地理系，Tzai Hung Wen，2018 Wenlab501
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