这个程序计算给定化学物种的同位素分布/模式。
pyisopach的Python项目详细描述
pyisopach-一个“相当快”的python同位素模式计算器
这是DIMEdb项目的姊妹包这个程序计算给定化学物种的同位素分布/模式
安装
pyISOPACh需要Python 3+,不幸的是它与Python 2不兼容如果您仍在使用Python 2,一个聪明的解决方法是安装Python 3并使用它
安装pyisopach最简单的方法是使用pip
:
pip install pyisopach
或者,您可以使用git
和pip
来获得开发分支:
pip install https://github.com/AberystwythSystemsBiology/pyISOPACh
示例用法
# Import the package into python>>>importpyisopach# Create Molecule object for Sucrose>>>mol=pyisopach.Molecule("C12H22O11")# Return molecular weight>>>mol.molecular_weight342.2970125766493# Calculate isotopic distribution/pattern>>>mol.isotopic_distribution()(array([342.11621155,343.11956639,344.12045733]),array([100.,12.97887395,2.260493]))
许可证
在the MIT license下发布的代码